GROMACS no Ubuntu 8.10

Faça o bootstrap.

./bootstrap

Configure com a precisão desejada (double irá gerar binários com sufixo _d) e habilite a "bendita" geração de bibliotecas dinâmicas.

./configure --enable-double --enable-shared

Caso esqueça de compilar com --enable-shared, limpe o build. Do contrário a compilação falha com algum erro que esqueci de olhar.